まず一つめは、キシリトールの甘さにより唾液を出させる効果です。唾液量が増えることにより緩衝能が高まり、歯の再石灰化を促進します。
二つめはプラーク中のミュータンス菌を減少させ、酸生成を抑制する効果です。ミュータンス菌は通常、糖を取り込みエネルギー源として酸を生成します。この酸がう蝕の原因となります。しかし、ミュータンス菌はキシリトールを取り込むことができないため弱ってしまい、酸も生成できなくなります。
糖の中にはソルビトールのような低酸生成の糖もありますが、キシリトールのように天然素材の糖で、ミュータンス菌を減少させ酸生成を抑制するもは他にありません。そのため、キシリトールはう蝕抑制効果が認められます。